Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
IRX1P78414 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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