Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SKP1P63208 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms