Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CLDN15P56746 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms