Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AQP4P55087 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AQP4P55087 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms