Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATP12AP54707 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms