Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCA4P51532 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCA4P51532 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms