Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GSK3BP49841 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GSK3BP49841 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms