Protein–RNA interactions for Protein: P34925

RYK, Tyrosine-protein kinase RYK, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYKP34925 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RYKP34925 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RYKP34925 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RYKP34925 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYKP34925 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYKP34925 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RYKP34925 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms