Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PSMB5P28074 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PSMB5P28074 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms