Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DNMT1P26358 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms