Protein–RNA interactions for Protein: P26010

ITGB7, Integrin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB7P26010 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ITGB7P26010 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms