Protein–RNA interactions for Protein: P25685

DNAJB1, DnaJ homolog subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB1P25685 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DNAJB1P25685 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DNAJB1P25685 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms