Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDSP20132 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDSP20132 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDSP20132 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDSP20132 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms