Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PTPRCP08575 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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