Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GJB1P08034 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GJB1P08034 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GJB1P08034 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GJB1P08034 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms