Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATP1B1P05026 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATP1B1P05026 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ATP1B1P05026 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms