Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms