Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CLDN25C9JDP6 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms