Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
B4E171 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
B4E171 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
B4E171 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
B4E171 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms