Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
KLF12Q9Y4X4 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
KLF12Q9Y4X4 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms