Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SH3BP1Q9Y3L3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms