Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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POLR1DQ9Y2S0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
POLR1DQ9Y2S0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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