Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIF3AQ9Y2N7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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