Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RCE1Q9Y256 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RCE1Q9Y256 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms