Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
USP18Q9UMW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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