Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
TRAPPC2LQ9UL33 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
TRAPPC2LQ9UL33 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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