Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TUBE1Q9UJT0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TUBE1Q9UJT0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms