Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD9

UBQLN2, Ubiquilin-2, humanhuman

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN2Q9UHD9 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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UBQLN2Q9UHD9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
UBQLN2Q9UHD9 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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