Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SCHIP1Q9P0W5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms