Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PDP1Q9P0J1 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PDP1Q9P0J1 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms