Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNIH4Q9P003 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNIH4Q9P003 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
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