Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FBXO28Q9NVF7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms