Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TDP1Q9NUW8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TDP1Q9NUW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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