Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
USP29Q9HBJ7 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
USP29Q9HBJ7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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