Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRDM12Q9H4Q4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms