Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEMA4CQ9C0C4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms