Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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CNTNAP3Q9BZ76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CNTNAP3Q9BZ76 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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