Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
BBS2Q9BXC9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
BBS2Q9BXC9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms