Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
HIGD2AQ9BW72 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
HIGD2AQ9BW72 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms