Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PKP4Q99569 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms