Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PHOX2BQ99453 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PHOX2BQ99453 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms