Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FGD4Q96M96 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms