Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CNBD2Q96M20 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CNBD2Q96M20 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms