Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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RNF185Q96GF1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
RNF185Q96GF1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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