Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ECHDC3Q96DC8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ECHDC3Q96DC8 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ECHDC3Q96DC8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ECHDC3Q96DC8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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