Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRUQ92729 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRUQ92729 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms