Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG68

TTL, Tubulin--tyrosine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLQ8NG68 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TTLQ8NG68 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms