Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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