Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD42Q8N9B4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms