Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RTL3Q8N8U3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RTL3Q8N8U3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms